紫外吸收檢測DNA濃度與純度2007年11月13日 星期二 11:40目的: 了解紫外吸收檢測DNA濃度與純度的原理,掌握測定方法。
原理: 核酸的最大吸收波長為260nm,蛋白質(zhì)為280nm,在波長260nm時,1OD值相當于雙鏈DNA濃度為50μg/ml,單鏈 寡核苷酸的含量為30μg/ml,可以據(jù)此來計算核酸樣品的濃度,還可通過測定在260nm和280nm的OD值的比值 (OD260/OD280),估計核酸的純度。純凈DNA的比值為1.8, RNA為2.0。
若比值高于1.8說明DNA樣品中的RNA尚未除 盡,若樣品中含有酚和蛋白質(zhì)將導致比值降低。270nm存在高吸收表明有酚的干擾。
紫外分光光度法只能用于測定濃度 大于0.25μg/ml的核酸溶液,對濃度更小的樣品,可采用熒光分光光度法。 試劑與儀器: 提取的質(zhì)粒DNA,紫外分光光度儀。
操作步驟: 1) 分光光度計先用水在260nm和280nm兩個波長下校零。 2) 取質(zhì)粒DNA樣品2μl,用水稀釋100倍,轉(zhuǎn)入分光光度計的石英比色杯中。
3) 在260nm和280nm分別讀出樣品光密度值。如果樣品濃度單位為μg/μl,則樣品DNA濃度為OD 值的10倍,即如 OD260=0.1,則樣品濃度即為1μg/μl。
4) 若OD260/OD280大于1.8,說明仍有RNA,可以考慮用RNA酶處理樣品,若小于1.8,說 明樣品中含有蛋白質(zhì)或酚,應再用酚/氯仿抽提,以乙醇沉淀純化DNA。
方法的驗證: 訂入質(zhì)量標準的含量測定法不同于一般質(zhì)量考察的方法,須經(jīng)過嚴格的方法學驗證,不同原理的測定法具有不同的驗證內(nèi)容及要求:
(1)容量分析法的驗證:①精密度:用原料藥精制品考察方法精密度,平行試驗5個樣本的RSD≤0.2%;②準確度:以測定原料精制品(含量>99.5%)的回收率(測定值與理論值的比值)計算,應在99.7%~100.3%之間(n=5,RSD≤0.1%);③滴定終點確定的依據(jù):包括滴定曲線的繪制,如用指示劑法確定終點,應用電位法校準終點顏色,提供指示劑顏色與電位變化情況的對比結(jié)果;④耐用性:考察測定條件(供試液穩(wěn)定性、樣品提取次數(shù)、時間等)有微小變動時,測定結(jié)果不受影響的承受程度,如測試條件要求苛刻時則應在方法中注明。
(2)HPLC法的驗證:①精密度:RSD≤2%(n=5);②準確度:用于制劑時,要考察輔料的影響,將一定量藥物加到按處方比例配制的輔料中(為標示量的80%~120%)制成高、中、低三個劑量,混合均勻后,每個劑量取三份樣品,按擬定方法測定回收率,應在98%~102%之間(n=9, RSD≤2%)。③線性范圍:用已知含量的精制品配制一系列濃度的溶液(n=5~7),用濃度C對峰面積A或峰高h或被測物的響應值之比進行回歸處理,線性方程的相關(guān)系數(shù)r≥0.999,截距應趨于零,并提供線性關(guān)系圖;④專屬性:輔料、有關(guān)物質(zhì)或降解產(chǎn)物峰對主藥峰應無干擾;⑤耐用性:考察測定條件(供試液穩(wěn)定性、流動相組成和pH值、不同品牌或批號的同類色譜柱、柱溫、流速、樣品提取次數(shù)、時間等)有微小變動時,測定結(jié)果不受影響的承受程度,如測試條件要求苛刻時則應在方法中注明;⑥靈敏度:作為常量分析法,此項可不作主要要求。
(3)UV法的驗證:①精密度:RSD≤1%(n=5);②準確度:方法同HPLC法,回收率應在98%~102%之間(n=9, RSD≤2%),同時要求輔料、有關(guān)物質(zhì)或降解產(chǎn)物在測定波長處無吸收。③線性范圍:用已知含量的精制品配制一系列濃度的溶液(n=5~7,吸收度A在0.2~0.7間),用濃度C對峰面積A或峰高h或被測物的響應值之比進行回歸處理,線性方程的相關(guān)系數(shù)r應≥0.999,截距應趨于零,并提供線性關(guān)系圖;④耐用性:考察測定條件(供試液穩(wěn)定性、樣品提取次數(shù)、時間、比色法中顯色劑用量、反應溫度、時間、pH值等)有微小變動時,測定結(jié)果不受影響的承受程度,如測試條件要求苛刻時則應在方法中注明;⑤靈敏度:作為常量分析法,此項可不作主要要求。
吸收度A在0.2~0.8間其線形關(guān)系好,利用標準品建立標準曲線后,受測溶液做適當?shù)南♂專蛊湮斩仍?.2~0.8,如果太小或太大,都將影響測定的準確性的。
化合物純度的鑒定方法
一 通過TLC的純度的鑒定 1 展開溶劑的選擇,不只是至少需要3種不同極性展開系統(tǒng)展開,通常是首先要選擇三種分子間作用力不同的溶劑系統(tǒng),如氯仿\甲醇,環(huán)己烷\乙酸乙酯,正丁醇\醋酸\水,分別展開來確定組分是否為單一斑點。這樣做的好處是很明顯的,通過組份間的各種差別將組分分開,有可能幾個相似組份在一種溶劑系統(tǒng)中是單一斑點,因為該溶劑系統(tǒng)與這幾個組分的分子間力作用無顯著的差別,不足以在TLC區(qū)分。而換了分子間作用力不同的另一溶劑系統(tǒng),就有可能分開。這是用3種不同極性展開系統(tǒng)展開所不能達到的。 2 對于一種溶劑系統(tǒng),至少需要3種不同極性展開系統(tǒng)展開,一種極性的展開系統(tǒng)將目標組分的Rf推至0.5,另兩種極性的展開系統(tǒng)將目標組分的Rf推至0.8,0.2。其作用是檢查有沒有極性比目標組分更大或更小的雜質(zhì)。 3 顯色方法,光展開是不夠的,還要用各種顯色方法。一般一定要使用通用型顯色劑,如10%硫酸,碘,因為每種顯色劑(不論是通用型顯色劑,還是專屬顯色劑在工作中都遇到他們都有一化合物不顯色的時候),再根據(jù)組分可能含有混雜組份的情況,選用專屬顯色劑。只有在多個顯色劑下均為單一斑點,這時才能下結(jié)論樣品為薄層純 二 通過熔程,判斷純度。原理很簡單,純化合物,熔程很短,1~2度?;旌衔锶埸c下降,熔程變長。 三,基于HPLC的純度鑒定,對于HPLC因為常用的系統(tǒng)較少,加之其分離效果好,我們一般不要求選擇三種分子間作用力不同的溶劑系統(tǒng),只要求選這三種不同極性的溶劑系統(tǒng),使目標峰在不同的保留時間出峰。 四,基于軟電離質(zhì)譜的純度鑒定。如ESI-MS,APCI-MS。大極性化合物選用ESI-MS,極性很小的化合物選用APCI-MS,這些軟電離質(zhì)譜的特點是只給出化合物的準分子離子峰,通過正負離子的相互溝通來確定分子量。如果樣品不純,就會檢出多對準分子離子峰,不但確定了純度,還能明確混雜物的分子量。 五,基于核磁共振的純度鑒定,從氫譜中如果發(fā)現(xiàn)有很多積分不到一的小峰,就有可能是樣品是樣品中的雜質(zhì)。利用門控去偶的技術(shù)通過對碳譜的定量也能實現(xiàn)純度鑒定。 這里只是對常見的純度鑒定方法做了一個小結(jié),從快速,便宜,簡便的要求出發(fā),以第一點最合要求,往后次之,所以對第一點詳加講述。當然每種方法多有各自的局限性,如基于氫譜的純度鑒定,如果發(fā)現(xiàn)有很多積分不到一的小峰,還有可能使樣品中的活潑質(zhì)子,基于軟電離質(zhì)譜的純度鑒定,如果混雜物的分子量與目標物一樣就無法 。
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