如何分析蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位
預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位,是通過(guò)生物信息學(xué)的方法的。
或者你在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中比對(duì)到了編碼類似蛋白的基因,如果該基因有人做過(guò)亞細(xì)胞定位的實(shí)驗(yàn),你也可以大概知道其編碼的蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)部的定位。不同物種,不同基因家族成員有可能有區(qū)別。最終還是需要實(shí)驗(yàn)來(lái)驗(yàn)證的。
功能基因研究中,經(jīng)常會(huì)進(jìn)行基因編碼的蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位的,
如待定位蛋白和GFP、YFP、RFP等融合后,觀察融合蛋白在細(xì)胞內(nèi)的定位,
或者將預(yù)測(cè)部位(如該蛋白可能在液泡膜上)的蛋白提取出來(lái),進(jìn)行western實(shí)驗(yàn),來(lái)驗(yàn)證等。
預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位,是通過(guò)生物信息學(xué)的方法的。
或者你在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中比對(duì)到了編碼類似蛋白的基因,如果該基因有人做過(guò)亞細(xì)胞定位的實(shí)驗(yàn),你也可以大概知道其編碼的蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)部的定位。不同物種,不同基因家族成員有可能有區(qū)別。
最終還是需要實(shí)驗(yàn)來(lái)驗(yàn)證的。功能基因研究中,經(jīng)常會(huì)進(jìn)行基因編碼的蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位的,如待定位蛋白和GFP、YFP、RFP等融合后,觀察融合蛋白在細(xì)胞內(nèi)的定位,或者將預(yù)測(cè)部位(如該蛋白可能在液泡膜上)的蛋白提取出來(lái),進(jìn)行western實(shí)驗(yàn),來(lái)驗(yàn)證等。
希望對(duì)你有幫助吧。
預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位,是通過(guò)生物信息學(xué)的方法的。
或者你在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中比對(duì)到了編碼類似蛋白的基因,如果該基因有人做過(guò)亞細(xì)胞定位的實(shí)驗(yàn),你也可以大概知道其編碼的蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)部的定位。不同物種,不同基因家族成員有可能有區(qū)別。最終還是需要實(shí)驗(yàn)來(lái)驗(yàn)證的。
功能基因研究中,經(jīng)常會(huì)進(jìn)行基因編碼的蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位的,
如待定位蛋白和GFP、YFP、RFP等融合后,觀察融合蛋白在細(xì)胞內(nèi)的定位,
或者將預(yù)測(cè)部位(如該蛋白可能在液泡膜上)的蛋白提取出來(lái),進(jìn)行western實(shí)驗(yàn),來(lái)驗(yàn)證等。
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1.對(duì)活細(xì)胞和組織或細(xì)胞組織切片進(jìn)行連續(xù)斷層掃描,能獲得精細(xì)的單個(gè)細(xì)胞或一群細(xì)胞或所觀察的局部組織的各個(gè)層面結(jié)構(gòu)(包括細(xì)胞特異結(jié)構(gòu)-如細(xì)胞骨架、染色體、細(xì)胞器和細(xì)胞膜系統(tǒng),樣品的深層結(jié)構(gòu))和完整的3D圖像;2. 細(xì)胞內(nèi)離子熒光標(biāo)記,單標(biāo)記、雙標(biāo)記或三標(biāo)記,甚更高多重標(biāo)記,檢測(cè)細(xì)胞內(nèi)如pH和鈉、鉀、鈣、鎂等離子濃度的比率測(cè)定及其動(dòng)態(tài)變化;3.熒光標(biāo)記探針標(biāo)記的活細(xì)胞或切片標(biāo)本的細(xì)胞生物物質(zhì),膜標(biāo)記、細(xì)胞示蹤、免疫物質(zhì)、免疫反應(yīng)、受體或配體,核酸等觀察;可以在同一張樣品上進(jìn)行同時(shí)多重物質(zhì)標(biāo)記,同時(shí)觀察;4.熒光檢測(cè)快、激發(fā)光強(qiáng)度精確控制、光漂白和熒光淬滅作用小;5.對(duì)細(xì)胞檢測(cè)無(wú)損傷、精確、準(zhǔn)確、可靠和優(yōu)良重復(fù)性;數(shù)據(jù)圖象可及時(shí)輸出或長(zhǎng)期儲(chǔ)存。
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